Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP6

MICAL3, [F-actin]-monooxygenase MICAL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAL3Q7RTP6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MICAL3Q7RTP6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms