Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP31Q70CQ4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP31Q70CQ4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP31Q70CQ4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP31Q70CQ4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP31Q70CQ4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP31Q70CQ4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP31Q70CQ4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP31Q70CQ4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP31Q70CQ4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP31Q70CQ4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP31Q70CQ4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP31Q70CQ4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP31Q70CQ4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP31Q70CQ4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP31Q70CQ4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP31Q70CQ4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP31Q70CQ4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP31Q70CQ4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP31Q70CQ4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP31Q70CQ4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP31Q70CQ4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP31Q70CQ4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP31Q70CQ4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP31Q70CQ4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP31Q70CQ4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP31Q70CQ4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
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