Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms