Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR88Q6ZMY6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms