Protein–RNA interactions for Protein: Q6XXX2

LINC00114, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00114, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00114Q6XXX2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms