Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms