Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms