Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms