Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms