Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDD2Q6NTF9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms