Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms