Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms