Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYOM3Q5VTT5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MYOM3Q5VTT5 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MYOM3Q5VTT5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
MYOM3Q5VTT5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYOM3Q5VTT5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYOM3Q5VTT5 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYOM3Q5VTT5 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MYOM3Q5VTT5 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYOM3Q5VTT5 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYOM3Q5VTT5 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYOM3Q5VTT5 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MYOM3Q5VTT5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYOM3Q5VTT5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYOM3Q5VTT5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MYOM3Q5VTT5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MYOM3Q5VTT5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYOM3Q5VTT5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYOM3Q5VTT5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYOM3Q5VTT5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYOM3Q5VTT5 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYOM3Q5VTT5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYOM3Q5VTT5 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYOM3Q5VTT5 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYOM3Q5VTT5 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms