Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTA0

PRAMEF17, PRAME family member 17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF17Q5VTA0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF17Q5VTA0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms