Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PXDC1Q5TGL8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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