Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms