Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms