Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms