Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms