Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms