Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms