Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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