Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
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