Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms