Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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