Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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