Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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