Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
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