Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms