Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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