Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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