Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
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NCF4Q15080 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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