Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

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Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
EEA1Q15075 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
EEA1Q15075 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
EEA1Q15075 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
EEA1Q15075 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
EEA1Q15075 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EEA1Q15075 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EEA1Q15075 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
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