Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRCAPQ14761 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms