Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
RRP1BQ14684 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
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