Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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COL9A2Q14055 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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COL9A2Q14055 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
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COL9A2Q14055 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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COL9A2Q14055 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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