Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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