Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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