Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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