Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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CDH18Q13634 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
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CDH18Q13634 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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CDH18Q13634 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
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CDH18Q13634 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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CDH18Q13634 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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CDH18Q13634 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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CDH18Q13634 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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