Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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