Protein–RNA interactions for Protein: Q13569

TDG, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDGQ13569 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDGQ13569 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDGQ13569 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDGQ13569 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDGQ13569 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDGQ13569 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDGQ13569 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDGQ13569 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDGQ13569 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TDGQ13569 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDGQ13569 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TDGQ13569 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDGQ13569 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDGQ13569 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDGQ13569 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDGQ13569 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDGQ13569 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDGQ13569 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDGQ13569 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDGQ13569 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDGQ13569 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDGQ13569 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDGQ13569 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TDGQ13569 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TDGQ13569 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TDGQ13569 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TDGQ13569 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TDGQ13569 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TDGQ13569 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDGQ13569 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDGQ13569 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TDGQ13569 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDGQ13569 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDGQ13569 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDGQ13569 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDGQ13569 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDGQ13569 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDGQ13569 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDGQ13569 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDGQ13569 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TDGQ13569 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TDGQ13569 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TDGQ13569 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TDGQ13569 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDGQ13569 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDGQ13569 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDGQ13569 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDGQ13569 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDGQ13569 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDGQ13569 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDGQ13569 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDGQ13569 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDGQ13569 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDGQ13569 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDGQ13569 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDGQ13569 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDGQ13569 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDGQ13569 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDGQ13569 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDGQ13569 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDGQ13569 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDGQ13569 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDGQ13569 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDGQ13569 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDGQ13569 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDGQ13569 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDGQ13569 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDGQ13569 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDGQ13569 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDGQ13569 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDGQ13569 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDGQ13569 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDGQ13569 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDGQ13569 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TDGQ13569 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDGQ13569 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TDGQ13569 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDGQ13569 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDGQ13569 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDGQ13569 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDGQ13569 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDGQ13569 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDGQ13569 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDGQ13569 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDGQ13569 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDGQ13569 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDGQ13569 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDGQ13569 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDGQ13569 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDGQ13569 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDGQ13569 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDGQ13569 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDGQ13569 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDGQ13569 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDGQ13569 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDGQ13569 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDGQ13569 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDGQ13569 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDGQ13569 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDGQ13569 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms