Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
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