Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPM6BQ13491 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms