Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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