Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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ITGB3BPQ13352 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
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ITGB3BPQ13352 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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ITGB3BPQ13352 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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ITGB3BPQ13352 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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ITGB3BPQ13352 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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ITGB3BPQ13352 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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ITGB3BPQ13352 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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