Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 COX6C-202ENST00000517682 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.664e-10■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 COX6C-201ENST00000297564 433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.744e-10■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 COX6C-207ENST00000522934 562 ntTSL 49.63□□□□□ -0.874e-10■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.954e-10■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.044e-10■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 COX6C-206ENST00000520517 566 ntTSL 47.06□□□□□ -1.284e-10■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.073e-11■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 MPG-202ENST00000356432 1205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)22.82■■□□□ 1.241e-6■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.161e-6■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.111e-6■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.115e-8■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.52e-7■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 YIF1B-205ENST00000585563 1118 ntTSL 321.39■■□□□ 1.012e-7■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 YIF1B-212ENST00000589644 1917 ntTSL 221.32■■□□□ 12e-7■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 YIF1B-209ENST00000588002 575 ntTSL 517.74■□□□□ 0.432e-7■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 YIF1B-211ENST00000589247 734 ntTSL 217.39■□□□□ 0.372e-7■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.692e-7■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.42e-7■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 SEC11A-205ENST00000558217 882 ntTSL 215.96■□□□□ 0.152e-7■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 SEC11A-203ENST00000558134 971 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.212e-7■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 SEC11A-202ENST00000455959 1223 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.952e-7■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 SEC11A-209ENST00000560266 1089 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.122e-7■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.769e-8■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.589e-8■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 PPOX-206ENST00000466452 784 ntTSL 211.16□□□□□ -0.623e-7■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 ISOC2-205ENST00000589080 763 ntTSL 217.22■□□□□ 0.352e-9■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 GOT2-201ENST00000245206 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.321e-7■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.816e-9■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 NDUFS7-208ENST00000538662 1186 ntTSL 218.12■□□□□ 0.496e-9■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.266e-9■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 NDUFS7-204ENST00000436115 2879 ntTSL 516.37■□□□□ 0.216e-9■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.692e-25■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.462e-25■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.342e-25■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 RPS15-211ENST00000592700 1602 ntTSL 222.14■■□□□ 1.142e-25■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.872e-25■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.662e-25■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.452e-25■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.452e-25■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.452e-25■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.452e-25■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.372e-25■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.876e-7■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.066e-7■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 ATG3-207ENST00000494571 2758 ntTSL 24.48□□□□□ -1.696e-7■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.325e-7■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.165e-7■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.318e-52■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 FAM178B-202ENST00000470789 722 ntTSL 1 (best)13.53□□□□□ -0.241e-8■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 FAM50A-207ENST00000494278 294 ntTSL 213.84□□□□□ -0.195e-7■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 FAM98B-204ENST00000559431 305 ntTSL 511.83□□□□□ -0.522e-6■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.568e-8■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.158e-8■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.758e-8■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 ISOC2-204ENST00000587226 854 ntTSL 519.75■□□□□ 0.752e-9■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 AP002990.1-201ENST00000526409 1954 ntTSL 520.03■□□□□ 0.87e-14■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 EEF1G-203ENST00000525340 2496 ntTSL 1 (best)16.49■□□□□ 0.237e-14■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.237e-14■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.077e-14■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 ALDH18A1-202ENST00000371224 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.265e-12■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 ALDH18A1-201ENST00000371221 3337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.445e-12■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 DDB1-203ENST00000451943 1224 ntTSL 29.5□□□□□ -0.893e-15■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 EPN1-206ENST00000589704 250 ntTSL 57.87□□□□□ -1.158e-9■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 EHMT2-206ENST00000461880 1825 ntTSL 515.94■□□□□ 0.148e-10■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.048e-10■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.028e-10■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.028e-10■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.078e-10■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 EHMT2-210ENST00000478491 1517 ntTSL 514.15□□□□□ -0.148e-10■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 EHMT2-211ENST00000480912 3940 ntTSL 512.26□□□□□ -0.458e-10■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 EHMT2-212ENST00000494816 3036 ntTSL 511.87□□□□□ -0.518e-10■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 ZNF414-206ENST00000596772 579 ntTSL 224.89■■□□□ 1.586e-7■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 ZNF414-204ENST00000594748 462 ntTSL 324.09■■□□□ 1.456e-7■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.066e-7■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 ZNF414-209ENST00000602128 443 ntTSL 220.81■□□□□ 0.926e-7■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 ZNF414-205ENST00000595348 368 ntTSL 219.82■□□□□ 0.766e-7■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 ZNF414-203ENST00000593661 512 ntTSL 319.79■□□□□ 0.766e-7■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.676e-7■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 TAF10-204ENST00000532344 638 ntTSL 228.9■■■□□ 2.222e-6■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 MRPL51-204ENST00000540949 343 ntTSL 220.88■□□□□ 0.931e-6■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 ATP5G1-208ENST00000513781 759 ntTSL 317.87■□□□□ 0.454e-14■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 ATP5G1-210ENST00000515060 433 ntTSL 315.94■□□□□ 0.144e-14■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 ATP5G1-204ENST00000503641 539 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.214e-14■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 ATP5G1-206ENST00000506855 468 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.354e-14■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 ATP5G1-202ENST00000393366 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.454e-14■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 ATP5G1-201ENST00000355938 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.464e-14■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 ATP5G1-203ENST00000502964 679 ntTSL 211.9□□□□□ -0.54e-14■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 ATP5G1-207ENST00000513347 2214 ntTSL 210.01□□□□□ -0.814e-14■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 MOSPD3-205ENST00000462372 979 ntTSL 528.52■■■□□ 2.163e-9■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.093e-9■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.012e-8■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.863e-9■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.733e-9■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 GRAMD1A-214ENST00000603907 450 ntTSL 224.48■■□□□ 1.513e-9■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 AGPAT2-204ENST00000472820 808 ntTSL 1 (best)24.01■■□□□ 1.433e-9■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.232e-8■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.163e-9■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.142e-8■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 POP5-209ENST00000543355 794 ntTSL 321.78■■□□□ 1.083e-9■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.913e-9■■■□□ 15.8
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