Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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