Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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