Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
STX4Q12846 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
STX4Q12846 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
STX4Q12846 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
STX4Q12846 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
STX4Q12846 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
STX4Q12846 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
STX4Q12846 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
STX4Q12846 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
STX4Q12846 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
STX4Q12846 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
STX4Q12846 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
STX4Q12846 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
STX4Q12846 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
STX4Q12846 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
STX4Q12846 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
STX4Q12846 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
STX4Q12846 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
STX4Q12846 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
STX4Q12846 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
STX4Q12846 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
STX4Q12846 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
STX4Q12846 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
STX4Q12846 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
STX4Q12846 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
STX4Q12846 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
STX4Q12846 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
STX4Q12846 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
STX4Q12846 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
STX4Q12846 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
STX4Q12846 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
STX4Q12846 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
STX4Q12846 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
STX4Q12846 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
STX4Q12846 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
STX4Q12846 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STX4Q12846 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STX4Q12846 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STX4Q12846 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STX4Q12846 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STX4Q12846 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
STX4Q12846 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STX4Q12846 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
STX4Q12846 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
STX4Q12846 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STX4Q12846 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STX4Q12846 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STX4Q12846 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
STX4Q12846 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
STX4Q12846 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STX4Q12846 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STX4Q12846 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
STX4Q12846 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STX4Q12846 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
STX4Q12846 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STX4Q12846 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STX4Q12846 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
STX4Q12846 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
STX4Q12846 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STX4Q12846 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
STX4Q12846 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
STX4Q12846 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STX4Q12846 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STX4Q12846 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
STX4Q12846 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STX4Q12846 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STX4Q12846 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
STX4Q12846 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STX4Q12846 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
STX4Q12846 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
STX4Q12846 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
STX4Q12846 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
STX4Q12846 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
STX4Q12846 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
STX4Q12846 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
STX4Q12846 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
STX4Q12846 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
STX4Q12846 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
STX4Q12846 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
STX4Q12846 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
STX4Q12846 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
STX4Q12846 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
STX4Q12846 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
STX4Q12846 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
STX4Q12846 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
STX4Q12846 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
STX4Q12846 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
STX4Q12846 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
STX4Q12846 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
STX4Q12846 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
STX4Q12846 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
STX4Q12846 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
STX4Q12846 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
STX4Q12846 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
STX4Q12846 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
STX4Q12846 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
STX4Q12846 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
STX4Q12846 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
STX4Q12846 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
STX4Q12846 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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